Dukka B. Kc

TitleAssistant Professor

DepartmentComputational Science and Engineering

Phone336-285-3210

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Emaildbkc@ncat.edu

OfficeFort IRC
Room: 303

1601 East Market Street
Greensboro, NC 27411

Dukka B. Kc

Education

Ph D: Bioinformatics, Kyoto University, 2006

Other: Bioinformatics, Kyoto University, 2003

Other: Computer Science, Kyoto University, 2001


Research Interests

Bioinformatics, Big Data


Recent Publications

Amini, Hossein  Hashemisohi, Abolhasan  Wang, Lijun  Shahbazi, Abolghasem  Bikdash, Marwan  Kc, Dukka  Yuan, Wenqiao  (2016).  Numerical and experimental investigation of hydrodynamics and light transfer in open raceway ponds at various algal cell concentrations and medium depths.  (156,  pp. 11-23).  Chemical Engineering Science.

Jha, Ashwani  Flurchick, Kenneth  Bikdash, Marwan  Kc, Dukka  (2016).  Parallel-SymD: A Parallel Approach to Detect Internal Symmetry in Protein Domains.  (2016,  pp. 1-9).  BioMed Research International.

Jiang, Y  Oron, T  Clark, W  Bankapur, A  D'Andrea, D  Lepore, R  Funk, C  Kahanda, I  Verspoor, K  Ben-Hur, A  da Koo, C  Penfold-Brown, D  Shasha, D  Youngs, N  Bonneau, R  Lin, A  Sahraeian, S  Martelli, P  Profiti, G  Casadio, R  Cao, R  Zhong, Z  Cheng, J  Altenhoff, A  Skunca, N  Dessimoz, C  Dogan, T  Hakala, K  Kaewphan, S  Mehryary, F  Salakoski, T  Ginter, F  Fang, H  Smithers, B  Oates, M  Gough, J  Törönen, P  Koskinen, P  Holm, L  Chen, C  Hsu, W  Bryson, K  Cozzetto, D  Minneci, F  Jones, D  Chapman, Samuel  Bkc, D  Khan, I  Kihara, D  Ofer, D  Rappoport, N  Stern, A  Cibrian-Uhalte, E  Denny, P  Foulger, R  Hieta, R  Legge, D  Lovering, R  Magrane, M  Melidoni, A  Mutowo-Meullenet, P  Pichler, K  Shypitsyna, A  Li , B  Zakeri, P  ElShal, S  Tranchevent, L  Das, S  Dawson, N  Lee, D  Lees, J  Sillitoe, I  Bhat, P  Nepusz, T  Romero, A  Sasidharan, R  Yang, H  Paccanaro, A  Gillis, J  Sedeño-Cortés, A  Pavlidis, P  Feng, S  Cejuela, J  Goldberg, T  Hamp, T  Richter, L  Salamov, A  Gabaldon, T  Marcet-Houben, M  Supek, F  Gong, Q  Ning, W  Zhou, Y  Tian, W  Falda, M  Fontana, P  Lavezzo, E  Toppo, S  Ferrari, C  Giollo, M  Piovesan, D  Tosatto, S  Del Pozo, A  Fernández, J  Maietta, P  Valencia, A  Tress, M  Benso, A  Di Carlo, S  Politano, G  Savino, A  Rehman, H  Re, M  Mesiti, M  Valentini, G  Bargsten, J  van Dijk, A  Gemovic, B  Glisic, S  Perovic, V  Veljkovic, V  Veljkovic, N  Almeida-E-Silva, D  Vencio, R  Sharan, M  Vogel, J  Kansakar, L  Zhang, S  Vucetic, S  Wang, Z  Sternberg, M  Wass, M  Huntley, R  Martin, M  O'Donovan, C  Robinson, P  Moreau, Y  Tramontano, A  Babbitt, P  Brenner, S  Linial, M  Orengo, C  Rost, B  Greene, C  Mooney, S  Friedberg, I  Radivojac, P  (2016).  An expanded evaluation of protein function prediction methods shows an improvement in accuracy..  (1,  17,  pp. 184).  Genome biology.

Kc, Dukka  (2016).  Recent advances in sequence-based protein structure prediction..   Briefings in bioinformatics.

Ismail, H  Newman, Robert  Kc, Dukka  (2016).  RF-Hydroxysite: a random forest based predictor for hydroxylation sites..  (8,  12,  pp. 2427-35).  Molecular bioSystems.

Jha, A  Flurchick, Kenneth  Bikdash, Marwan  Kc, Dukka  (2016).  Parallel-SymD: A Parallel Approach to Detect Internal Symmetry in Protein Domains..  (2016,  pp. 4628592).  BioMed research international.

Ismail, H  Jones, Adri-Anne  Kim, Jung  Newman, Robert  Kc, Dukka  (2016).  RF-Phos: A Novel General Phosphorylation Site Prediction Tool Based on Random Forest..  (2016,  pp. 3281590).  BioMed research international.